Différence entre le séquençage du génome entier et le séquençage du fusil de chasse

Quels sont le séquençage du génome entier et le séquençage de fusil de chasse?

Ce sont des méthodes utilisées pour évaluer et les séquences d'ADN du génome d'un organisme en un seul moment.

Similarité

Les similitudes entre le séquençage du génome entier et le séquençage du fusil de chasse comprennent;

• Les deux sont impliqués dans le séquençage des fragments d'acide désoxyribonucléique
• Les deux techniques impliquent une fragmentation génomique
• Les deux techniques utilisent la numérisation et sont basées sur ordinateur
• Les deux techniques jouent un rôle essentiel dans les études de recherche et dans les diagnostics moléculaires

Séquençage du génome entier

Le séquençage du génome entier AKA (WGS) est une technique détaillée pour étudier toute la séquence d'acide désoxyribonucléique génomique d'une cellule en un seul moment.

Le séquençage du génome entier est devenu disponible après avoir publié le projet du génome humain, qui a fourni la référence aux séquences du génome humain.

Séquençage de fusil de chasse

Le séquençage du fusil de chasse implique une séparation imprévue de séquences d'acide désoxyribonucléique décomposant en de nombreux petits fragments, puis en les assemblant (la séquence) en déterminant les régions du chevauchement.

Différence entre le séquençage du génome entier et le fusil de chasse

Description

Séquençage du génome entier

Le séquençage du génome entier (WGS) est un processus d'arrangement en une étape. Dans cette technique, l'ensemble du génome (ensemble haploïde de chromosomes dans un micro-organisme) a lieu en premier. Après cela, chacun de ces minuscules éclats cassants subit un processus d'arrangement au hasard. Une fois cet arrangement ou séquençage terminé, l'analyse a lieu. Il y a l'élimination du processus de séquençage qui se chevauchez au moment de l'évaluation des arrangements / séquences, et l'évaluation n'est pas une technique ordonnée. Par conséquent, l'assemblage des séquences est un processus moins réussi et efficace. Cependant, le processus de séquençage du génome entier est plus rapide, et l'évaluation de l'ensemble du génome (ensemble haploïde de chromosomes dans un micro-organisme) peut avoir lieu dans un seul cas.

Séquençage de fusil de chasse

Le séquençage du fusil de chasse est une méthode de laboratoire pour évaluer la séquence d'acide désoxyribonucléique du matériel génétique d'un organisme (génome). La technique est inclusive de diviser le matériel génétique de l'organisme en minuscules fragments d'acide désoxyribonucléique qui représentent le séquençage individuel.

Les usages

Séquençage du génome entier

• Nouvelle-né et maladie pédiatrique - Déduit les variantes structurelles et analyse les zones exoniques qui ne sont pas capturées de manière appropriée.
• Essais de médicaments et pharmacogénomique - WGS offre un mécanisme frontal bénéfique pour les essais cliniques, qui aident à classer les individus (patients) sur la base de leur réponse au médicament ou au médicament à l'étude.
• Variation réglementaire et EQTLS
• Types de rumeurs rares - WGS est la bonne méthode pour étudier les tumeurs rares. La technique aide à étudier et à capturer la gamme complète de mutations, des changements de base unique (une seule base dans l'acide désoxyribonucléique diffère de la base habituelle à cette position) à des réarrangements chromosomiques plus importants, dans une expérience ponctuelle.
• Clan Genomics - Pedigrees de la maladie familiale - Taps Taps Multiplex Pedigrees des familles touchées par les problèmes génétiques.
• Grandes cohortes avec un phénotypage étendu

Séquençage de fusil de chasse

• Étudie la séquence d'acide désoxyribonucléique du génome d'un organisme.
• Méthode efficace pour séquencer indirectement l'acide ribonucléique ou les protéines (via leurs cadres de lecture ouverts)
• La méthode la plus préférée pour tous les autres types d'ensemble haploïde de chromosomes dans un séquençage de micro-organisme. L'ensemble haploïde total de chromosomes de nombreux organismes, - la vache, le poulet, le rat, la plante Arabidopsis thaliana, le poisson-ballot et de nombreux organismes microscopiques ont été séquencés après cette technique.
• Assemblages de novo presque finis et presque finaux de génomes microbiens en très moins de jours
• La puissance de séquences de grands génomes complexes
• GS FLX + Système de lecture des longueurs jusqu'à 1 Ko
• Effectuer des assemblages hybrides

Pas

Séquençage du génome entier

• Génération de séquençage se lit directement à partir d'un référentiel Génome (haploïde haploïde dans un micro-organisme)
• Application de méthodes de calcul pour remonter en un seul étape
• Utilisé pour la mouche des fruits (Drosophila melanogaster) et par Celera Genomics (développé 1998) pour le génome humain (ensemble haploïde de chromosomes dans un micro-organisme)

Séquençage de fusil de chasse

• Les étapes du séquençage de fusil de chasse incluent;
• Préparation de bibliothèque
• Séquençage des fragments d'ADNc
• Comptage des fragments
• Alignement de séquence
• Analyse statistique et rapports.

Résumé

Les points de différence entre le séquençage du génome entier et le séquençage du fusil de chasse ont été résumés comme ci-dessous:

Séquençage du génome entier vs séquençage de fusil de chasse